Пациентам поступающим в клинические подразделения кафедры экспериментальной медицины CIRM под руководством проф. Юрия Захарова выполняется специальное исследование микробиома кишечника 16S позволяющее скорректировать опосредованно аутоиммунитет устранив при некоторых подтипах СД 1 типа саму причину заболевания. Микробиота кишечника оказывает сильное влияние на иммунную систему не только на уровне кишечника, но и системно, а также модулирует внекишечные аутоиммунные заболевания, такие как диабет 1 типа. Эффекторные Т-клетки мигрируют из кишечника в периферические лимфоидные органы и ткани, а хроническое воспаление и изменение соотношения Т-эффекторных/Т-регуляторных клеток в слизистой оболочке кишечника лежат в основе патогенеза внекишечных аутоиммунных заболеваний, таких как диабет 1 типа, как было показано на людях и в доклинических моделях.
Эти данные подтверждают предположение о том, что внекишечные аутоиммунные заболевания и диабет 1 типа можно предотвратить, способствуя формированию благоприятного профиля кишечной микробиоты и восстановлению правильного иммунного гомеостаза на кишечном уровне.
При этом, иммунную систему модулирует не наличие специфических штаммов бактерий, а связанные с микробиотой метаболические пути, индуцируемые на кишечном уровне различными микробными сообществами. В исследовании, проведенном у детей с атопией, иммунная дисрегуляция и аллергия были связаны с активацией микробных генов, связанных со специфическими метаболическими путями.
Короткоцепочечные жирные кислоты (КЖК), а именно бутират, пропионат и ацетат, являются метаболитами, продуцируемыми бактериальными сообществами, которые используют ксилан, ксилозу и карбоксиметилцеллюлозу для своего метаболизма, и имеют решающее значение для поддержания целостности кишечного барьера и кишечного иммунного гомеостаза.
Обогащенная КЖК метаболическая среда кишечника способствует иммунной толерантности за счет усиления экспансии клеток FoxP3 + Treg. Это привело к гипотезе о том, что обогащенная короткоцепочечными жирными кислотами метаболическая среда кишечника может предотвратить внекишечные аутоиммунные заболевания, такие как диабет 1 типа, путем восстановления иммунной толерантности на кишечном и системном уровнях.
Обогащенная короткоцепочечными жирными кислотами (КЖК) метаболическая среда кишечника предотвращает аутоиммунный диабет. Специализированные диеты, которые вызывают высвобождение большого количества ацетата или бутирата при бактериальной ферментации, предотвращают аутоиммунный диабет. Ацетат преимущественно воздействует на B-клетки, снижая их антигенпрезентирующую функцию и способность распространять аутоиммунные Т-клеточные ответы на различные собственные эпитопы островковых антигенов. Бутират расширяет субпопуляцию FoxP3 + Treg-клеток, которая имеет решающее значение для поддержания аутотолерантности и предотвращает аутоиммунный диабет. Оба иммуномодулирующих эффекта опосредуются эпигенетическими механизмами, включающими модификации гистонов: увеличение активности гистондеацетилазы (HDAC) в B-клетках и ацетилирование локуса FoxP3 в FoxP3 + Treg-клетках. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5719145
